Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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