Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDGFDQ9GZP0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFDQ9GZP0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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