Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms