Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms