Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms