Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms