Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms