Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TINF2Q9BSI4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms