Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms