Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms