Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms