Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms