Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms