Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNC2Q96PR1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms