Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms