Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms