Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms