Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms