Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2Q8WZ74 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms