Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAAF4Q8WXU2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms