Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SLC14A1-204ENST00000436407 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CCDC120-207ENST00000606812 3857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MPP4-201ENST00000315506 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 FNDC3A-201ENST00000378383 2037 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PACSIN1-206ENST00000538621 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PLAGL1-203ENST00000367571 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MAMDC2-201ENST00000377182 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 LINC01910-201ENST00000582251 2637 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 HHAT-207ENST00000541565 3164 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TAF1A-AS1-201ENST00000413074 1313 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MASP1-201ENST00000169293 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 C8orf86-201ENST00000358138 2250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC098657.2-201ENST00000567886 1976 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DNM1L-211ENST00000547312 2393 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AP000894.2-201ENST00000581719 3902 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms