Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms