Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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