Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPAP2Q8IXW5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms