Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms