Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF554Q86TJ5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms