Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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USP53Q70EK8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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