Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms