Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms