Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms