Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms