Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms