Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL22Q53GT1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms