Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms