Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms