Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms