Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF6Q330K2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms