Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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CCDC142Q17RM4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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