Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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