Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HADHQ16836 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HADHQ16836 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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