Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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