Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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