Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EXT1Q16394 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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EXT1Q16394 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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EXT1Q16394 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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EXT1Q16394 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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EXT1Q16394 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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EXT1Q16394 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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