Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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