Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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NEDD8Q15843 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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