Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms