Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms