Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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