Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms