Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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